1、大小和密度
海水珍珠一般比淡水珍珠大，海水珍珠的珠径一般为6至7.5毫米， 而淡水珍珠的颗粒较小。海水珍珠的密度一般都小于淡水珍珠，并且更轻。
2、珍珠品质
海水珍珠由于在海洋中生长，复杂的海洋环境使海水珍珠的品质比淡水珍珠的品质要好很多倍，海水珍珠稀少。品质自然也是上乘。不管是光泽还是亮度都比海水珍珠更胜一筹。淡水珍珠一般多为养殖，且品质不如海水珍珠。
3、成分
淡水珍珠是没有核的，所有的成分都是由珍珠质组成的，因此，倘若用淡水珍珠做珍珠粉话，不会掺杂任何的杂质。而海水珍珠则是有所不同，海水珍珠是有核的，它的核一般是由猪蹄蚌的贝壳磨成，珍珠质是覆盖在珍珠表面上的。
4、产地
淡水珍珠产于各类湖泊、江河和溪流中，世界上约95%的淡水珍珠都产于中国。海水珍珠产于大海中，海水珍珠根据不同细分种类，有产于中国、日本、澳大利亚、菲律宾、马来西亚、法属波利尼西亚等主要国家。
5、外形
淡水珍珠颜色常见的有白、粉、橘、紫等丰富颜色，形状各异，大部分不圆，正圆少，多数为椭圆、扁圆、米型、腰线型、异形等。海水珍珠常见的颜色有白、金、银灰、透绿等各种丰富颜色。海水珍珠一般都偏正圆，少部分椭圆、腰线型、异形的。
