南京理工大学研究生院创办于2004年，是经教育部批准的研究生院，从事南京理工大学研究生教育工作，学校经过多年发展，已形成了较为完备的研究生招生、培养、学位授予体系，学校重视科技创新，专利申请和授权数量均位居全国高校前列，是“全国专利工作试点示范高校”，创办了全国第一个依托大学和大学科技园建设的国家专利产业化试点基地，为推进成果转化、加强社会服务构建了一个新平台，此外，学校所培养的人才也在各自的工作岗位上为国民经济建设和国防现代化建设做出了积极的贡献。
南京理工大学研究生院既是教育中心，又是科技中心，设有科学研究院和30余个研究机构，拥有1个国家级重点实验室，2个国家级工程技术研究中心，1个国家级质检中心，3个部省级重点实验室，并以此为依托形成了一批重点科研基地，承担了一大批国家重大科研任务。
